Le baromètre Inserm est composé du baromètre des publications et du baromètre Santé.

Le Baromètre des Publications

Conformément à son engagement dans la politique de Science Ouverte, l’Inserm propose son baromètre.

Mis en place par le Ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Espace (MESRE) dans le cadre du Plan National pour la Science Ouverte, le baromètre de la science ouverte (BSO) illustre le pourcentage et l’évolution des publications en accès ouvert, c’est-à-dire mises en ligne sans barrière technique ou financière.

Le BSO Inserm a été mesuré par le Département de la Science Ouverte (DSO) à partir du code et des données mis à disposition par le MESRE dans la nouvelle version du baromètre national 2026.

L’année principalement illustrée ici est 2024. L’évolution globale est présentée de 2018 à 2024. Seules les publications scientifiques dont au moins un auteur est affilié à l’Inserm et qui possèdent un DOI ont été prises en compte.

Note qui concerne la mise à jour du baromètre des publications en février 2026 – Dans le BSO 2026, on observe pour les données des années 2024 et antérieures (extraites fin 2025) une « rupture de série » relative à l’un des outils utilisé dans le traitement et l’enrichissement des données (Unpaywall). En effet, le profil d’évolution des taux d’accès ouverts au cours des années évaluées est globalement similaire à celui du BSO 2025 mais les valeurs absolues de ces taux sont sensiblement plus faibles. A titre d’exemple, le taux d’ouverture pour l’année 2023 de 84% dans le BSO 2025 sort à 79% dans le BSO 2026. Il ne s’agit donc pas d’une baisse de l’accès ouvert mais d’une variation méthodologique. Ces détails sont précisés dans les commentaires des visualisations proposées.

Evolution des frais de publications Open Access

Commentaire

Les dépenses en APC issues d’auteurs correspondants Inserm sont évaluées depuis 2015 jusqu’à 2024. D’avantage d’informations sur le site Inserm.

Evolution des dépôts de preprints dans bioRxiv et medRxiv

Commentaire

Le nombre de preprints dont au moins un auteur est affilié à l’Inserm est présenté.
Les DOI des preprints ont été répertoriés en fonction de l’année du dépôt de la première version avant toute publication potentielle.

La méthodologie

Les sources de données

Les données des publications 2013 à 2024 dont au moins un auteur est affilié à l’Inserm et possédant un DOI, sont issues d’extractions réalisées en décembre 2025, à partir des plateformes HAL, Web of Science et PubMed.
Les données sur les dépenses Inserm en frais de publication Open Access ou Article Processing Charges (APC) ont été recueillies a partir des données comptables dans le cadre de l’enquête nationale du réseau Couperin et ont été versées sur la plateforme OpenAPC.
Les données de preprints (2013 à 2024 pour bioRxiv et 2019 à 2024 pour medRxiv) dont au moins un auteur est affilié à l’Inserm sont répertoriées dans un fichier Excel en fonction de l’année du dépôt de la première version.

La procédure

Après extractions depuis les bases de données citées précédemment, les DOI de toutes les publications 2013-2024 sont isolés conformément à la méthode indiquée dans le BSO de l’Université de Lorraine.
Ces données sont ensuite croisées et enrichies par le MESRE grâce à l’API UnPaywall qui permet d’établir une correspondance entre le DOI et divers champs d’informations qui permettront les traitements ultérieurs et donc la génération d’indicateurs pertinents.
Le MESRE, après traitement des données transmises par les institutions, met également à disposition de ces dernières les visualisations élaborées pour réutilisation dans le cadre de leur propre baromètre.

Dans une perspective d’uniformité, seules les publications de type « article de revue » identifiées par un DOI sont prises en compte.

Le code du baromètre

La plupart des visualisations proposées correspondent aux indicateurs du baromètre de la Science Ouverte national avec une version locale pour l’Inserm, mise à disposition par le MESRE.
L’Inserm propose deux visualisations propres à l’Institut : L’évolution des dépenses en frais de publication Open Access (APC) et l’évolution des dépôts sur les plateformes de preprints medRxiv et bioRxiv.
Les visualisations produites par le DSO Inserm ont été élaborées à partir des librairies Highcharts et Plotly.

Une mention au bas des graphiques précise la source.

Le code, les données et les requêtes sont en ligne sur GitHub : https://github.com/Inserm-IST/BSO-Inserm.

Dates de mise à jour

• Code : mis à jour en février 2025
• Données : extractions en décembre 2025

Le Baromètre Santé

Le second Plan national pour la Science Ouverte ambitionne de promouvoir l’ouverture de la science au-delà des publications.
Il prévoit ainsi de développer le baromètre de la science ouverte en introduisant de nouveaux indicateurs, en particulier, le suivi des études en santé, notamment des essais cliniques.

Actuellement, le Ministère de l’enseignement supérieur de la recherche publie le Baromètre santé de la Science Ouverte, celui-ci couvre l’ensemble des études en santé en France.

Suivant cette initiative, l’Inserm a décidé de créer sa déclinaison du baromètre santé, couvrant les études en santé dont il est le promoteur, en portant une attention particulière aux points suivants :

• L’inclusion de tous les types d’études en santé :
  Les essais cliniques (y compris non-médicamenteux) ainsi que les études observationnelles.
• La Prise en compte des résultats d’études négatifs :
  Comme le souligne le MESR :« … les résultats d’essais cliniques négatifs ou peu concluants, qui sont difficiles à valoriser dans une publication scientifique, soient bien rendus publics et correctement diffusés. Ils constituent en effet des apports précieux sur le plan scientifique et les essais dont ils découlent ne devraient pas être ignorés ou inutilement dupliqués. »

Taux de publications faisant suite à des études dont le promoteur est l’Inserm

Parmi ces 265 études, 139 ont donné lieu à au moins une publication de résultats dans une revue, soit un taux de publication d’environ 48%.

Nombre d’études avec communication de résultats par année de fin

Les chiffres des dernières années sont susceptibles d’évoluer, car les chercheurs déclarent souvent la fin de leurs études sur les plateformes après la date réelle de conclusion.

Nombre d’études avec communication de résultats par type d’étude

Nous nous intéressons au nombre d’études ayant donné lieu à au moins publication de résultats dans un journal, en fonction de leur nature (essai clinique ou étude observationnelle).

Nous constatons que les essais cliniques sont majoritaires par rapport aux études observationnelles.

Durée des études

Nous nous intéressons à la durée des études en fonction de la nature de l’étude (essai clinique ou étude observationnelle).

L’étude la plus courte a une durée de 61 jours, la plus longue 21,3 années.

Nous constatons que les études les plus longues sont des études observationnelles.

Délai entre la fin de l’étude et la première publication dans un journal

Nous nous intéressons au délai entre la fin de l’étude et la première publication de résultats dans un journal.

Une valeur négative indique que la première publication de résultats a eu lieu avant la fin de l’étude.
Il est courant pour les études de longue durée de donner lieu à plusieurs publications au fil de l’étude.
Par exemple, si une étude dure 20 ans mais publie des résultats 5 ans après son début, on obtiendra une valeur de -15 ans.

À l’autre extrême, nous remarquons une étude dont la première publication de résultats s’est faite 10 ans après sa fin.

Statut OpenAccess des résultats publiés

Les statuts Open Access sont définies de la manière suivante par OpenAlex et Unpaywall :

• Gold : Publication en accès libre dans une revue indexée par le Directory of Open Access Journals (DOAJ).
  Principe de l’auteur payeur : ce dernier s’acquitte de frais, appelés APC (Article Processing Charge), liés à la publication de son article, qui devient immédiatement accessible à tous, gratuitement.
• Green : Publication dans une revue à accès payant, mais une copie gratuite est disponible dans une archive Open Access, par exemple HAL.
• Hybrid : Publication lisible gratuitement dans une revue à accès payant.
  Ce modèle, basé sur un double paiement (abonnement + frais pour publication en Open Access), est fortement déconseillé.
• Bronze : Publication lisible gratuitement sur la page de l’éditeur, sans licence accordant d’autres droits.
  Il peut y avoir un délai entre la publication et la disponibilité en lecture, et les articles peuvent être retirés unilatéralement par l’éditeur.
• Closed : Tous les autres articles qui ne sont pas en accès libre.

Sur les 403 publications de résultats dans un journal à la suite d’une étude, 302 sont en accès libre, soit un taux d’ouverture d’environ 75%.

Domaines de recherche

Les publications sont étiquetées avec des sujets par OpenAlex, à l’aide d’un système automatisé qui prend en compte les informations disponibles sur la publication, y compris le titre, le résumé, le nom de la source (revue) et les citations.

Chaque publication recoit un domaine, un champ, sous-champ et un sujet, du moins spécifique au plus spécifique.

Par exemple: Health Sciences > Medicine > Infectious Diseases > Efficacy and Safety of Antiretroviral Therapy for HIV

Parmi les publications considérées comme des résultats, nous nous intéressons aux sous-champs d’OpenAlex les plus populaires, avec au minimum 3 publications.

La méthodologie

Les données utilisées pour élaborer ces graphiques ont été extraites de la plateforme ClinicalTrials, mise en place par le NIH et sur laquelle l’Inserm s’est engagé à déclarer l’ensemble des essais cliniques et études observationnelles dont il est le promoteur.

Les requêtes ont été lancées sur l’API Clinical Trials pour récupérer les études satisfaisant les critères suivants :

• Ayant pour sponsors l’INSERM, l’ANRS et leurs variations possibles.
• Qui sont terminées.
• Dont la date de fin se situe entre le 01/01/2014 et le 31/12/2024.

Dans une perspective d’homogénéité, seules les études dont le statut est « COMPLETED » ont été prises en compte.
Ce sont les essais qui se sont terminés sans encombre et comme prévu, les patients ne sont plus traités ni suivis.

Après la collecte des études et des PMID des publications associées, nous avons utilisé les API de :

• PubMed pour enrichir ces publications avec le titre, les auteurs, le DOI, etc.
• Unpaywall pour récupérer le statut Open Access de ces publications.
• OpenAlex pour retrouver le domaine de recherche des publications.

Enfin, un traitement manuel a été effectué afin de vérifier la nature de ces publications collectées automatiquement et d’exclure celles ne correspondant pas à un résultat (backgrounds, protocoles, lettres aux éditeurs, erratum, etc.).

Les requêtes et le traitement des données sont exécutés au sein d’un Notebook Jupyter accessible à l’adresse: https://github.com/Inserm-IST/BSO-Inserm-Sante.
Les visualisations ont été élaborées à partir des bibliothèques Highcharts for Python et Plotly.