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Les Fondamentaux

DSO

Le département de la Science ouverte (DSO) impulse et porte la politique de science ouverte de l’Inserm, propose des plateformes et portails documentaires (InsermBiblio, le MeSH bilingue, HAL-Inserm, PhotoScience, iPubli), et gère le service des archives de l’Inserm.
Il réalise des analyses bibliométriques et produit des indicateurs scientométriques pour aider aux processus d’évaluations et à la décision de politique scientifique.
Enfin, il informe et accompagne les chercheurs et les chercheuses dans leurs pratiques de la science ouverte avec sa plateforme Service Open Science (SOS).

Liens Internet
La science ouverte à l’Inserm sur Inserm Pro
La science ouverte sur Inserm.fr

L’approche FAIR

La science ouverte est la mise à disposition gratuite de tous des produits de la recherche issus de fonds publics, visant une libre réutilisation des données sous licences libres. Afin de réussir l’ouverture, il est proposé de suivre le principe FAIR, acronyme qui signifie Facile à trouver, Accessible, Interopérable et Réutilisable.

Facile à trouver : Attribuer un identifiant pérenne et renseigner les métadonnées
Accessible : Mettre en place un stockage durable
Interopérable : Utiliser un format standard et ouvert
Réutilisable : Favoriser la réutilisation en utilisant des licences ouvertes

Faire des principes FAIR une réalité sur OuvrirLaScience.fr
Les principes FAIR sur ccsd.cnrs.fr

Charte de la Science Ouverte Inserm

La charte de l’Inserm affirme des principes destinés à faciliter la transition de la recherche vers des publications ouvertes, des données ouvertes et partagées, une évaluation favorable à la science ouverte, et une généralisation de la science participative.
Charte Science Ouverte sur Inserm Pro

Les identifiants pérennes

Un identifiant pérenne permet d’identifier de manière unique, sans ambiguïté et de façon permanente les chercheurs et leurs travaux de recherche. Il est utilisé dans de nombreux systèmes d’information des établissements de recherche et dans les services à la recherche.
Orcid.org
L’identifiant numérique pérenne Orcid sur Inserm Pro
PID OPIDoR
ROR.org
DataCite Fabrica pour la gestion des DOIs
SoftWare Heritage persistent IDentifiers (SWHIDs)

Lexique de la science ouverte

Le vocabulaire de la science ouverte est détaillé sur le site d’Ouvrir la science.

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Formation

Le DSO propose des formations pour vous familiariser avec la science ouverte. Ces formations peuvent être dispensées à titre individuel, collectif ou selon une thématique particulière.
Par exemple les grands textes fondateurs dans leur contexte historique et financier, les principes FAIR et l’adage Aussi ouvert que possible, aussi fermé que nécessaire, les voies de publications, les droits et devoirs des chercheurs, les licences et la stratégie de non-cession des droits, les informations et discussion sur les APC et le modèle hybride, le cycle de vie et la gestion des données.

Information
La science ouverte à l’Inserm

• Les formations déjà existantes

Plusieurs formations sur la Science Ouverte sont disponibles sur la plateforme Callisto, notamment la formation OSCAR développée par l’INRAE.

Sorbonne Université propose une formation sur la plateforme FUN-MOOC intitulée « La Science Ouverte ».

• Documentation

MESR, Passeport pour la Science Ouverte. Guide pratique à l’usage des doctorantes et des doctorants. 2021.

MESR, Passeport pour la Science Ouverte. Entrez dans le débat. 2022

La petite encyclopédie de la science ouverte, Ouvrir la Science, 2025.

Les données de la recherche, Aix-Marseille Université, 2024.

Le cycle de vie des données : un outil pour améliorer la gestion, la mise en qualité et l’ouverture des données, Université de Limoges, 2024.

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Bibliographie

InsermBiblio

InsermBiblio est la bibliothèque numérique de l’Inserm. Elle offre aux unités de recherche et aux équipes de l’Inserm un accès en texte intégral à des milliers de revues scientifiques, à des bases de données et à des outils bibliographiques ou bibliométriques.

Lien Internet
InsermBiblio.fr

Qui contacter ?
InsermBiblio@inserm.fr

MeSH

Le MeSH (Medical Subject Headings) est le thésaurus de référence dans le domaine biomédical. Il sert à l’indexation des bases de données de la National Library of Medicine (USA), notamment PubMed issu de Medline. Le MeSH est mis à jour chaque année et l’Inserm produit sa version française : MeSH.Inserm.fr

Qui contacter ?
MeSH.dso@inserm.fr

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Projet de Recherche

Le Plan de Gestion des Données (PGD)

Le PGD (ou Data Management Plan – DMP) est un document méthodologique sous format numérique. Il est évolutif et permet d’organiser au mieux ses données afin d’en faciliter l’accès, l’exploitation, la valorisation et la conservation. Un espace dédié sur le site DMP OPIDOR permet de créer, de partager et de lire des PGDs d’autres entités de l’Inserm. Il est accessible après la création d’un compte d’utilisateur institutionnel sur OPIDoR.

Liens Internet
PGD sur Inserm Pro
Modèles de PGD Inserm sur DMP OPIDoR
DMP OPIDoR, un outil d’aide à la création en ligne de PGD
Modèles de PGD sur DMP OPIDoR

Qui contacter ?
support-pgd@inserm.fr

Projet de recherche impliquant l’humain

En France, la recherche sur l’humain est strictement encadrée par la loi. Quand les données de santé issues de cette recherche sont anonymisées, elles doivent respecter non seulement les principes FAIR mais également les dispositions du règlement européen de protection des données (RGPD).

Pour en savoir plus sur La recherche clinique à l’Inserm

Qui contacter ?
promoteur.inserm@inserm.fr

Science et société – La recherche participative

Dans le cadre de sa politique de SO et se fondant sur la charte des Sciences et Recherches Participatives (SRP) signée en 2017, l’Inserm a décidé de promouvoir les relations entre citoyens non chercheurs, notamment les associations de patients, et les scientifiques. Ces partenaires non académiques peuvent être force de proposition sur des questions de recherche, voire contribuer ou collaborer aux projets de recherche.

Pour en savoir plus sur La recherche participative à l’Inserm

Comité d’Evaluation Ethique de l’Inserm

A l’Inserm, le Comité d’Evaluation Ethique de l’Inserm (CEEI) accompagne les chercheuses et chercheurs pour intégrer la démarche éthique à la démarche scientifique.

Intégrité Scientifique – LORIER

Le programme Lorier vise à construire et à faire vivre une culture de recherche éthique et responsable au meilleur niveau d’exigence internationale.
L’intégrité scientifique à l’Inserm sur Inserm Pro

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Stratégie de publication

Les politiques de Science Ouverte

Les publications issues des travaux de recherche majoritairement financés par des fonds publics doivent répondre aux principes des politiques institutionnelles, nationale, voire européenne, de science ouverte.

Le libre choix de publication

Les auteurs peuvent publier de façon « classique » dans un journal sous abonnement et exigeant la cession des droits d’auteurs. Ils peuvent également choisir la voie « Dorée » en s’acquittant des frais d’édition (Article Processing Charges, APC), la voie « Diamant » ou la voie « Bronze ».
Si l’auteur souhaite publier dans une revue « hybride », il est fortement déconseillé de choisir l’option payante permettant les publications de l’article en accès ouvert. De fait, ces revues sont sous abonnements payés annuellement par l’Inserm et il est anormal de devoir payer en plus les APC. Cependant, des accords particuliers avec certains éditeurs permettent la prise en charge des APC y compris dans les titres hybrides. Les chercheurs rémunérés par l’Inserm peuvent ainsi publier dans certaines revues de ces éditeurs sans payer les frais d’édition liés à l’accès ouvert. Les informations sur ces accords sont disponibles sur InsermBiblio.

La seule condition imposée est de déposer le manuscrit (Manuscrit Auteur Accepté – MAA), dans une archive ouverte telle que HAL-Inserm dès l’acceptation par l’éditeur (voie Verte). Il est également possible de soumettre ses travaux à une plateforme de prépublications avant la soumission à la revue de son choix.

Les voies de l’accès ouvert

Frais de publications ou APC (Article Processing Charges)

Le répertoire des revues en Acces Ouvert DOAJ.org
Open policy finder sur jisc.ac.uk
Le réseau Mir@bel
Recensement des coûts des APC sur OpenAPC.net
Enquête APC : recueil et analyse des dépenses de publication sur Couperin.org

Plateformes de prépublications (preprints)

Peer Community in
MedRxiv
BioRxiv
Review Commons, plateforme de peer review de preprints
La plateforme Short Notes sur FC3R
In&Sight

La stratégie de non-cession des droits : Licences

CreativeCommons.org
GNU.org
CeCILL, licence française de logiciels libres (CEA, CNRS et Inria)
Guide méthodologique : Choix des licences open data sur OpenDataFrance
ChooseALicense.com
Sélecteur de Licence de l’ÙFAL à Prague
Licence Ouverte / Open Licence sur Etalab.gouv.fr

Eviter les revues prédatrices

Le répertoire des revues en Accès Ouvert DOAJ
Le répertoire des livres en Accès Ouvert DOAB
Think Check Submit
Le test Compass to Publish de l’Université de Liège

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Evaluation

Processus d’évaluation à l’Inserm

L’évaluation à l’Inserm est menée dans le respect des préconisations de la déclaration DORA en reconnaissant (2018) la nécessité d’améliorer les méthodes d’évaluation des chercheurs et des résultats de la recherche. Depuis 2024, l’Inserm participe activement aux travaux européens de CoARA (Coalition pour l’Avancement de l’Évaluation de la Recherche) sur les nouveaux processus d’évaluation et co-préside le chapitre national français. Le Département de l’Evaluation (Dev) est en charge de l’ensemble de ces sujets.

L’adhésion et l’engagement des chercheurs en faveur de la science ouverte et du suivi de la politique institutionnelle et nationale sont, aujourdhui, pris en compte et valorisés lors des évaluations des personnes ou des laboratoires.

Liens Internet
Declaration on Research Assessment (DORA)
Chapitre français de la Coalition pour l’Avancement de l’Évaluation de la Recherche (CoARA)
Évaluation scientifique : des valeurs Inserm à la réforme européenne sur Inserm Pro

Qui contacter ?
evaluation.dev@inserm.fr

Scientométrie et bibliométrie

Le pôle scientométrie-bibliométrie produit des indicateurs bibliométriques dans le cadre des campagnes d’évaluations institutionnelles (CSS, CS, Hcéres). En tenant compte des changements apportés dans le processus d’évaluation, il ne fournit pas d’indicateurs pour des demandes individuelles (chercheurs, unités de recherche ou Institut Thématique).

Qui contacter ?
scientometrie.dso@inserm.fr

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EDI

L’entrepôt de données Inserm (EDI) sur la plateforme Recherche Data Gouv permet de préserver, de partager et d’ouvrir les données de recherche conformes aux principes FAIR. Cette infrastructure, mise à la disposition des scientifiques par le ministère de la Recherche, s’inscrit dans le développement de la science ouverte.

Liens Internet
L’entrepôt de données Inserm (EDI) sur Inserm Pro
Sélectionner un entrepôt thématique de confiance pour le dépôt de données sur Ouvrir La Science.fr

Qui contacter ?
support-edi@inserm.fr

Outils de vérification de format de fichiers avant de déposer
Pour que le partage et la diffusion soient les plus ouverts possible, il est fortement conseillé de déposer les fichiers dans un format ouvert par opposition aux formats propriétaires (gérés par des entreprises privées).
Quiz : Format ouvert ou fermé ? sur DORANum.fr
CINES FACILE – Service de validation de formats

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Conservation

Archives

Le service des archives met des moyens documentaires et humains ainsi que des outils à la disposition des laboratoires et des services administratifs. La conservation des archives physiques et numériques fait partie intégrante de la maîtrise du cycle de vie des données. Elle est organisée en tenant compte des aspects scientifiques, juridiques et patrimoniaux.

Introduction générale : Finalité et organisation des archives à l’Inserm sur Inserm Pro
Outils de gestion de l’archivage (physique et numérique) : Guides et bonnes pratiques, Référentiels de conservation et Tableaux de gestion
Procédures de versement, d’élimination d’archives et externalisation
Foire Aux Questions

Qui contacter ?
archives.dso@inserm.fr

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